Conky jako takie działa, zmieniła się składnia plików, więc albo trzeba ją zmienić ręcznie w każdym widgecie albo potraktować skryptem – żadna aktualizacja tego nie naprawi, zwłaszcza jeśli są to pliki w twoim katalogu domowym.
Najprościej zastosować się do tej instrukcji, tylko zmień ~/.config/conky/ na ścieżkę w której trzymasz swoje configi conky.
EDIT: Albo do tej instrukcji – z tą różnicą że ostatnie polecenie będziesz musiał powtórzyć dla każdego pliku conkyrc.