Skoro już zdążyłeś pozbyć się starego systemu to nie ma to za bardzo sensu – a problem na 99% leżał w twojej konfiguracji. Jedyne sytuacje gdy możesz uruchomić Dolphin z uprawnieniami root to albo zalogowanie się jako root (co domyślnie jest niemożliwe bez kombinacji) albo uruchomienia samego Dolphina z podwyższonymi uprawnieniami – tu jest tylko jeden sposób opisany zresztą tutaj.
Jest to użytkownik specjalnego przeznaczenia z minimalnymi uprawnieniami dla aplikacji, które tego potrzebują – kiedyś był często wykorzystywany, dziś już rzadko (w zasadzie z bardziej znanych usług tylko NFS jeszcze z niego nie zrezygnowało) – ale skoro system go utworzył no najprawdopodobniej jest potrzebny którejś aplikacji (ewentualnie jest utrzymywany w ramach wstecznej kompatybilności). Obecnie jak jakiś program tego wymaga to raczej tworzy swojego usera. Jak zajrzysz do /etc/passwd to zobaczysz całkiem sporą listę takich użytkowników.